Flora

La gran extensión del Parque Regional de la Cuenca Alta del Manzanares favorecen la presencia de ecosistemas representativos de cuatro de los cinco pisos bioclimáticos de la región mediterránea de la Península Ibérica.

Por la amplitud de su superficie, sobresale el encinar carpetano, que representa el 62% del Parque. Además, son destacables los quejigales, las fresnedas, los pinares de montaña, los roquedos, los piornales, los pastizales supra-arbóreos y los rebollares, así como los sotos, articulados alrededor del Manzanares y sus afluentes, con especial mención a los dos embalses principales de este río, el de Santillana y el de El Pardo.

También abundan arbustos y matorrales característicos de la vegetación mediterránea, como la jara pringosa, el romero, el tomillo y el cantueso.

El Parque Regional de la Cuenca Alta del Manzanares ha sido objeto de diversas repoblaciones forestales, principalmente de coníferas, como el pino negral, el ciprés, el cedro y la arizónica, además de pino piñonero, silvestre y laricio.

Este espacio natural cuenta con zonas de una gran singularidad botánica. Sus bosques más representativos son el abedular de La Pedriza, el alcornocal de la Sierra del Hoyo, el enebral de Hoyo de Manzanares y el sabinar de Becerril de la Sierra, además de los montes de El Pardo y de Viñuelas, considerados como los encinares adehesados mejor conservados de Europa.

- Academic. Abedular de La Pedriza (2010)

Fauna

En lo que respecta a la fauna, se han clasificado alrededor de 300 especies de vertebrados, algunas de las cuales en peligro de extinción, que se unen a un número, aún sin cuantificar, de invertebrados.

- Mamíferos. Entre los mamíferos, existen interesantes poblaciones de ardilla, comadreja, conejo, ciervo, corzo, gamo, gato montés, garduña, gineta, jabalí, liebre, lirón careto, tejón y zorro, así como de cabra montés, que aparece superpoblada en La Pedriza, tras haber sido reintroducida con notable éxito. La superpoblación de mamíferos es también una característica del Monte de El Pardo, en este caso de especies cinegéticas. Periódicamente se realizan matanzas de animales en este paraje, con objeto de garantizar el equilibrio ecológico.

- Aves. En el capítulo de la fauna avícola, merece una mención especial el águila imperial ibérica, una de las aves más amenazadas del mundo. Se estima que en el Monte de El Pardo y en su apéndice, el Monte de Viñuelas, habitan ocho parejas reproductoras, en lo que constituye el segundo hábitat más importante de la Comunidad de Madrid. La lista de rapaces del Parque Regional se completa con el águila real, el águila calzada, el águila culebrera, el águila pescadora, el búho real, el búho chico, el cárabo, el cernícalo, el elanio, la lechuza, el milano real, el milano negro, el mochuelo y el ratonero. El Parque también reúne una importante fauna de aves acuáticas. En los embalses de Santillana y de El Pardo, habitan especies como la cigüeña negra, el cormorán grande, la grulla común, la gaviota reidora y diferentes anátidas. A lo largo del curso del río Manzanares, principalmente en su cabecera, se reúnen fochas, garzas reales, porrones, somormujos y zampullines. Otras especies avícolas del Parque Regional de la Cuenca Alta del Manzanares son, entre otras, el abejaruco, la abubilla, la codorniz, el cuco, la paloma torcaz, el martín pescador, la perdiz, el petirrojo y el picapinos, además de aves de rapiña, como el buitre negro y el buitre leonado.

- Reptiles y anfibios. El Parque reúne el 56,5% de los anfibios que habitan en la Península Ibérica y el 59,5% de los reptiles. Además, presenta un elevado número de endemismos, con un total de doce especies de herpetos. Entre los lugares más valiosos para la preservación de la herpetofauna, sobresale la Cuerda Larga, que constituye una zona de conservación de primer orden para la lagartija serrana, que tiene una distribución muy restringida en el territorio peninsular. Además, el galápago europeo, seriamente amenazado en la Comunidad de Madrid, tiene en el embalse de Santillana uno de sus principales refugios regionales.

- Peces. El río Manzanares y, principalmente, los embalses construidos sobre su curso albergan poblaciones de barbo, carpa, lucio y trucha.